理学院由原数学系和物理与教育技术系于2008年合并组建而成，现有数学与应用数学、物理学、教育技术学、科学教育、信息与计算科学共五个本科专业，致力于面向地方基础教育和经济社会文化发展培养应用型创新人才。现有数学与应用数学、物理学、教育技术学三个专业招生，在校学生数为997人。
理学院师资力量雄厚，拥有一支爱生敬业、治学严谨、团结协作、结构合理的师资队伍。现有教职员工52人，其中教授7人，副教授16人，高级实验师1人，讲师28人。各学历层次中有博士7人（2人在读），硕士25人。拥有省级教学名师1名，云南省突出贡献人才奖获得者1名、玉溪市中青年学科带头人5名。数学与应用数学教学团队为省级教学团队，理论物理团队为云南省教育厅高校科研创新团队。
学院坚持“以学生能力形成核心，促进学生知识、能力、素质协调发展”的办学理念，高度重视学生创新实践能力的培养，构建了完备的实践教学体系，拥有优良的实验实习条件。现有物理实验教学中心、教育技术实验中心和数学与应用数学实验中心三个实验中心，下设22个实验室，其中物理实验中心为校级实验教学示范中心。实验室总面积3000多平方米，教学仪器设备值达600万元，完全满足本院各专业实验教学和全校理工类专业基础物理实验的需要，实验开出率达100%，不断增加综合性、设计性、创新性实验。建设有10余个校外实习实践基地。学院着力推进教学建设与改革，大力提高人才培养质量，先后获得省、校级本科教学工程项目40余项、省校级教学奖励30余项。近年来学生参加全国大学生数学建模竞赛60多人次分获国家级和省级奖励，“挑战杯”大学课外学术活动等比赛，获国家级奖5项，省部级奖50余项；学生省、校级创新创业训练项目60余项；考研人数及录取率逐年上升，近五年毕业生考取香港中文大学、四川大学、西南大学、云南大学、宁波大学、浙江师范大学、南京师范大学、西北师范大学、广西大学等院校的研究生累计达70多人。毕业生的能力素质深受社会好评，近五年的平均就业率达96%以上。
在做好人才培养工作的同时，理学院高度重视科研和学科建设工作，形成了教学与科研相互促进的良性发展模式。拥有物理学、数学两个校级重点学科，在天体物理、统计物理与复杂系统、光谱分析、代数、微分方程等学科方向上具有一定的研究实力，形成了结构合理的科研团队。近五年来，由本院老师主持的项目有：国家自然科学基金资助1项、国家青年自然科学基金项目1项、国家教育部重点项目1项、云南省应用基础研究计划面上项目8项，云南省教育厅科学研究基金项目6项、高校横向联合项目1项，各项资助和学校的配套资助经费近260万元。在国内外相关学术刊物上累计发表论文200多篇，其中70多篇被SCI、EI、ISTP、MR、ZBL索引。获得省级科研奖励3项、地厅级科研奖励10余项。
“十二五”期间，我院将以加强本科专业建设、提高人才培养质量核心，着力推进人才培养模式改革，强化师资队伍建设，不断提升学科水平和科研实力，积极为地方经济社会文化发展作出贡献，为实现学校“申请硕士点、创建区域性高水平大学”的目标而努。
